Yo aplicaría el mismno criterio que para el término descodificar/decodificar:
Manuel Seco, en su Diccionario de dudas usa 'descodificar', aunque señala que 'decodificar' también es una forma registrada por la Academia (pero, por ahora, demodular/desmodular no están incluidas).

El libro de estilo de El País dice: Lo castellano es 'descodificar'

Por otro lado, en la carrera (Teleco) siempre hemos usado 'demodular'.

¡Suerte!